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从Tn5结构来看如何利用Tn5进行文库构建
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在NGS领域,tn5酶算是明星了,不管是表观建库如ATAC-seq、CUT&Tag还是在极速建库领域抑或是一步法建库技术等等的应用都颇为广泛,完全是主角的存在。那tn5酶是怎么完成建库的呢? 

原始Tn5酶是由两个1.5 kb的IS50插入序列夹带的抗生素耐药区组成,IS50L和IS50R。它是通过多步骤酶切-粘贴机制行使功能。具体为:两分子tn5转座酶单体首先结合到IS50元件末端的两个19 bp区域(OE序列和IE序列),然后通过二聚体形成突触复合体;转座酶促进重组的三个核心步骤 

1.这些蛋白可以识别移动元件末端的特定DNA序列,并将它们配对形成突触复合体;

2.这些蛋白在元件的每一端切割DNA,将元件的3'OH端从嵌入的DNA中解放出来;

3.这些蛋白促进新的DNA位点上的末端的两个磷酸二酯键被攻击,从而将元件的基因组连接到新的DNA片段。水在裂解阶段扮演亲核试剂的攻击角色,而元件的3 '羟基在DNA连接阶段(称为DNA链转移)扮演亲核试剂的角色[1]。


  2022-07-27    380

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